乙十年（公元前1307年）春，商彭联军正式出兵征讨蓝夷。联军首先对被蓝夷占领的盂地发起进攻，蓝夷军队虽顽强抵抗，但面对装备精良、配合默契的商彭联军，很快陷入被动。经过三日激战，联军收复盂地，解救了被俘虏的商朝平民。随后，联军继续向东推进，直指蓝夷的核心部落驻地。蓝夷首领见联军势不可挡，试图率领部落向西逃窜，却被早已埋伏在西侧的商朝军队拦截。双方在今山东泰安一带展开决战，商彭联军凭借战车优势与步兵方阵，彻底击溃蓝夷军队，俘虏了蓝夷首领，残余的蓝夷族人被迫投降，承诺永远臣服商朝，不再袭扰边境。

平定蓝夷后，祖乙将军事重点转向班方。班方位于今山东聊城一带，与蓝夷素有勾结，在蓝夷被征讨时，曾出兵支援蓝夷，因此成为祖乙的下一个目标。祖乙十一年（公元前1306年），商彭联军挥师北上，征讨班方。班方国君深知自身实力不敌联军，试图向东南方的淮夷部落求援，但淮夷部落因畏惧商朝的军威，拒绝出兵。孤立无援的班方军队在联军的进攻下节节败退，最终被迫投降，班方国君亲自前往庇都向祖乙请降，承诺每年向商朝缴纳双倍贡赋，并派质子（国君之子）前往商朝都城作为人质。

经过两年的军事行动，祖乙彻底平定了蓝夷、班方等夷族部落，消除了东南边境的威胁。这场胜利不仅稳定了商朝的边疆秩序，让边境平民得以安居乐业，还极大地提升了商朝的政治威望——周边的小诸侯纷纷前往庇都朝见祖乙，重新确认与商朝的从属关系，商朝的疆域也向东扩展至今山东东部，向南延伸至淮河中下游，为“中兴”事业奠定了广阔的空间。

祖乙的“中兴”并非仅靠迁都与军事胜利，更依赖于他“任贤用能、全面治理”的治国策略。其中，任用巫贤辅政是他最重要的决策之一。巫贤作为名臣巫咸之子，不仅精通天文地理，还在经济、民生、人才选拔等领域有着独到的见解，祖乙继位后，便任命巫贤为“卿士”（商朝最高官职，相当于后世的宰相），让其全面辅佐朝政，两人形成了“君明臣贤”的良好搭档。

在经济与民生治理方面，巫贤在祖乙的支持下，推行了一系列务实政