单于虽未参与叛乱，却无力管束下属，导致部族内乱，罪不可赦，于是逼迫南匈奴单于与其弟左贤王自杀。随后，陈龟又打算将南匈奴单于的近亲迁徙至中原内郡，这一举措让原本已经归降的南匈奴部众心生狐疑，人人自危，叛乱的隐患再度加剧。刘保得知此事后，大为震怒，即刻将陈龟下狱治罪，同时采纳大将军梁商的招降之策，命马续与周边各郡遵照执行，安抚南匈奴部众。在朝廷的招抚之下，南匈奴右贤王部抑鞮等一万三千人相继投降，南匈奴的叛乱之势稍有缓和。

同年秋，句龙吾斯等人依旧贼心不死，拥立句龙王车纽为单于，建立反叛政权，与东汉朝廷分庭抗礼。车纽成为单于后，积极联络各方势力，东引乌桓部族，西收羌戎及诸胡部落，合兵数万人，叛军势力再度壮大。这支联军声势浩大，接连攻破京兆虎牙营，杀死上郡都尉及军司马，随后又大举侵略并州、凉州、幽州、冀州四州，所到之处，庐舍为墟，百姓流离失所，四州之地陷入混乱。同年冬，刘保决意彻底平定叛乱，派遣匈奴中郎将张耽率领幽州乌桓诸郡营兵，前往讨伐叛虏车纽等部。张耽率领大军与叛军在马邑展开激战，汉军将士奋勇杀敌，叛军虽人数众多，却军心涣散，最终被汉军大破，斩首三千级。车纽见大势已去，率领麾下各个豪帅、骨都侯向朝廷乞求投降，唯有吾斯拒不归降，仍与乌桓部族联合，继续在边境抄掠，为祸一方。

永和六年（141年）春，马续率领鲜卑五千骑兵，进军穀城，攻打吾斯所部。两军在穀城交锋，汉军与鲜卑骑兵协同作战，大破吾斯军，斩首数百级，吾斯残部再度溃逃。与此同时，护匈奴中郎将张耽率领汉军，在边境展开艰险作战，汉军将士绳索相悬，攀越险峻山势，直上天山，绕至乌桓军后方，发起突袭，大破乌桓部众，将其渠帅悉数斩杀，成功解救出被乌桓掳掠的汉族百姓，缴获大量畜生、财物，乌桓势力遭受重创，无力再与吾斯联合犯边。

汉安元年（142年）秋，吾斯的残部仍未被肃清，他又与薁鞮台耆、且渠伯德等人勾结，再度率领部众寇略并州，并州各地守兵竭力抵御，边境的战事依旧未休，朝廷的平叛之战仍在继续。